2018. 4. 12. 11:02
Study/Magnetic tweezers
- input data : bead.txt, bead_motors.txt, offset.txt,offset_motors.txt
- bead.txt : xCetner(um), yCenter(um), z(um, PIFOC DAC value at each magnet height)
- bead_motors.txt : 1번 파일에 대응되는 magnet height
- offset.txt :xCetner(um), yCenter(um), z(um, PIFOC DAC value at lowest force magnet height)
- offset_motors.txt : 3번 파일에 대응되는 magnet height
reference :
Lansdorp BM & Saleh OA (2012) Power spectrum and Allan variance methods for calibrating single-molecule video-tracking instruments. Rev Sci Instrum 83(2):025115.
te Velthuis AJ, Kerssemakers JW, Lipfert J, & Dekker NH (2010) Quantitative guidelines for force calibration through spectral analysis of magnetic tweezers data. Biophys J 99(4):1292-1302.
Bouchiat, et al. Biophys J 76:409 (1999)
- 총 4개의 section과 low level function 존재
- 첫 번째 section(FX1_DETERMINE_ZOFFSET) : offset data loading 및 위치 결정
- 두 번째 section(FX2_LOAD_RAW) : data loading 및 분석준비
- 세 번째 section(FX3_ANALYZE) : 각 자석 높이에 따른 힘 분석 (real space, PSD, A.V, S.A)
- 네 번째 section(FX4_ANALYZE_Lp_Lc) : 분석된 힘을 이용하여 persistence length 및 contour length 결정
'Study > Magnetic tweezers' 카테고리의 다른 글
| FX4_ANALYZE_Lp_Lc (0) | 2018.04.12 |
|---|---|
| FX3_ANALYZE (0) | 2018.04.12 |
| FX2_LOAD_RAW (0) | 2018.04.12 |
| FX1_DETERMINE_ZOFFSET (0) | 2018.04.12 |
| 장비 세부 내역 (0) | 2018.04.06 |